雅马哈的第4代车型受到广大欢迎后，对于第5代R6车型的外观设计，品牌采取了审慎的策略，并未进行大刀阔斧的变革。在外观上，主要进行了微妙而精细的调整。例如，车头风挡的角度更为低矮，侧边整流罩的造型有所变化，排气管进行了微妙的调整，以及日间行车灯的形状更新。
要区分第4代和第5代R6的外观设计，观察日间行车灯的形状是最主要的方式。第4代的日间行车灯呈现出圆润的形态，而第5代则采用了更加锋利、具有几何特征的设计。从远处看，两者几乎无法区分。
尽管外观上的改变微乎其微，第4代R6和第5代R6的内在差异却十分显著。车架部分采用了全新的设计，其中最引人注目的改变是引入了仿照Y-R1的电子可变进气机构YCC-I。这一可变机构能够智能调整进气管的长度，从而大幅度提升吸气效率。
在发动机工作时，由于空气质量的影响，空气无法立即流入。调整进气管长度会对吸气效率产生重要影响。在高转速时，较短的进气管能够吸入更多空气，从而提高车辆性能。雅马哈已经深入研究并应用自然吸气的吸气脉动技术，将这一原理发挥到极致。
随着转速的变化，该系统能够自动调整进气管长度。在较低转速、吸气力较弱时，会增加进气管长度以加速空气流动；而在较高转速、吸气力较强时，则会缩短进气管长度，增加进气流量。这一技术的运用旨在拓宽R6的动力带，同时保持超高的转速范围。除此之外，雅马哈还对曲轴、气门弹簧和凸轮链条等关键部件进行了优化。
尽管R6采用了这种先进的可变进气技术，但它依然是一款纯粹的赛道用车，并不适合新手驾驶。对于普通驾驶者来说，雅马哈所提到的较低转速实际上是指13750rpm以下，这一转速区间在日常驾驶中很少能达到。
R6在超跑领域的定位非常明确，其独特的排气声浪也达到了车迷的极致期待。短排气管的设计让排气声浪悦耳动听，优雅且浑厚。在2010年日本加强噪音法规后，这一代R6不得不加长排气管，原本独特的优雅声浪也因此受到了影响。
尽管雅马哈因这一改动受到了批评，但为了符合销售许可要求，他们也只能做出妥协。至于下一代车型的推出，已经让车迷等待了许久，让人翘首以盼。
